على الرغم من الفوائد الصحية والقيمة الغذائية العالية التي يمكن الاستمتاع بها عند تناول المخ، لكن هناك بعض المخاطر والأضرار الصحية التي يجب الانتباه إليها.
يحتوي المخ على نسبة عالية من الكوليسترول، تقدر بحوالي أكثر من 10 أضعاف الحد اليومي الموصى به، ما يمكن أن يرفع معدل الكوليسترول الضار بالجسم، ويؤثر على صحة وسلامة القلب والأوعية الدموية.
وفي بعض الأحيان، يشكل تناول المخ خطر على صحة الشخص حال إصابة دماغ البقر أو الجاموس أو الخرفان بأحد التهابات الدماغ أو الاضطرابات التنكسية العصبية، ما يستوجب التأكد من سلامة مخ الحيوانات ومصدرها.