ما هو ارتباط التعبير الجيني؟
تم إثبات ارتباط التعبير الجيني عبر مجموعة متنوعة من الاضطرابات التجريبية لتجميع الجينات ذات الوظيفة المماثلة، نظرًا لأن نهج الذنب من خلال الارتباط قد يؤدي إلى مجموعات إيجابية خاطئة فقد تم تحسين الأساليب من خلال مقارنة أخصائيين تقويم العظام عبر الأنواع المتباينة مما يشير إلى أن التعبير المشترك المحفوظ للغاية هو مؤشر قوي على أن جينين سيعملان في مسارات متشابهة.
يشير هذا إلى أن الجينات المرتبطة وظيفيًا تخضع لقيود تعبير مماثلة تم عرض شبكات التعبير المشترك للجينات التي تستند إلى هذه العلاقات في أنواع متعددة على أنها خالية من المقاييس بشكل متكرر، وتظهر بنية عالمية صغيرة مشابهة لشبكات تفاعل البروتين، على الرغم من أنها بشكل عام مرتبطة بقوة أكبر، ومع ذلك لا يزال من غير الواضح إلى أي درجة يمكن لخصائص الشبكة للجينات الفردية داخل شبكة التعبير المشترك أن تتنبأ بأهمية الجينات النسبية لعملية معينة.
لتقييم ذلك تم بناء ثلاث شبكات على أساس مقياس مرجح للتوصيل، للتعبير الجيني المترابط في الخميرة باستخدام ثلاث مجموعات بيانات ميكروأري منفصلة، تم تقييم العلاقات بين الأساسيات والاتصال لكل جين داخل الشبكة بأكملها، علاوة على ذلك فإنه يحدد الوحدات النمطية (مجموعات من الجينات شديدة الارتباط)، ويقرر أنه في بعض الحالات يمكن الاستدلال على الأهمية النسبية للجينات داخل هذه الوحدات من اتصال الشبكة.
لقد أثبت أن الجينات التي تتمتع بتوصيلية عالية (أي جينات المحور) داخل شبكة التعبير المشترك الموزونة من المرجح بشكل كبير أن تكون ضرورية لجدوى الخميرة، علاوة على ذلك تظهر وجود علاقة بين الاتصال وقياس الحفظ المتسلسل، وأخيرًا يظهر أن بعض الوحدات الحيوية يتم حفظها من شبكة إلى أخرى وأنه في كثير من الحالات من الممكن توسيع العلاقة بين الاتصال والأساسية أو بين الاتصال والحفظ ضمن وحدات معينة، وبالتالي فإن تحليل شبكات التعبير المشترك للجينات يوفر نظرة ثاقبة على الأهمية الوظيفية للجينات الفردية داخل وحدات الجينات المعبر عنها بشكل مشترك.