ما هي خصائص شبكة الجينات؟
إن خصائص شبكات التعبير المشترك للجينات الموزونة المكونة من مجموعات بيانات ميكروأري متعددة، إذ تتقارب الشبكات المُنشأة الهيكل الخالي من المقاييس لكن هذا ليس عالميًا عبر جميع مجموعات البيانات، تظهر ارتباطات إيجابية قوية بين اتصال الجينات داخل الشبكة بأكملها وأساسيات الجينات بالإضافة إلى حفظ تسلسل الجينات، ومن الممكن ملاحظة وجود علاقة قوية بين الاتصال والأساسية أو بين الاتصال والحفظ داخل الوحدات النمطية خاصة داخل الوحدات التي تحتوي على أعداد أكبر من الجينات الأساسية.
باستخدام نظرية الشبكة أسفرت هذه الدراسات عن رؤى ثاقبة للأنظمة البيولوجية، على سبيل المثال تعرض كل من شبكات تفاعل البروتين وشبكات التعبير المشترك للجينات نمطية قوية تعكس التقسيم الوظيفي، ولقد لوحظ بشكل متكرر أن كلا نوعي الشبكات هذين لهما طوبولوجيا خالية من المقاييس مع وجود عقد محورية متصلة للغاية.
الشبكات الخالية من المقاييس مقاومة للاضطرابات العشوائية ولكنها حساسة للإزالة المستهدفة للعقد شديدة الارتباط، حيث توفر الجهود الشاملة لتحديد العواقب الوظيفية لعمليات حذف الجينات الفردية في الخميرة الفرصة لدراسة العلاقة بين خصائص شبكة الجينات الفردية ومدى فتك حذف الجينات، على سبيل المثال سمحت دراسات التفاعل الفيزيائي في الخميرة بمقارنة الاتصال بأساسيات الجينات بناءً على حذف الجينات.
كنموذج للشبكات الخالية من المقاييس كان هناك عدد قليل من البروتينات شديدة الارتباط داخل الشبكة، ومن المرجح أن يكون حذف البروتين مع عدد كبير من شركاء الارتباط مميتًا في الخميرة، وبالتالي يرتبط الموضع النسبي للعقد داخل شبكة تفاعل البروتين بقوة بخصائص بيولوجية مميزة للبروتينات الفردية، وبالمثل كشف تحليل شبكات التعبير المشترك للجينات غير الموزونة عن وجود علاقة بين الاتصال والأهمية عبر جميع الجينات.