ما هو تحليل الارتباط للجينات؟
إن استخدام الخرائط الفيزيائية للعلامات يشبه تحليل الارتباط للجينات، بمعنى أنه كلما اقتربت زاد احتمال بقائها معًا ومع ذلك، فإن إحدى طرق رسم الخرائط الفيزيائية هي استخدام إنزيم تقييد الهضم، ويتم هضم إما الجينوم بأكمله أو الحيوانات المستنسخة الكبيرة المفردة من مكتبة باستخدام مجموعة متنوعة من إنزيمات التقييد المختلفة، إذ سيقوم كل إنزيم بهضم الحمض النووي إلى أجزاء مختلفة الحجم، والتي يتم بعد ذلك فحصها لعدة علامات مختلفة من( STS أو EST).
فإذا كانت علامتان متقاربتان من بعضهما البعض فغالبًا ما يتم العثور عليهما في جزء التقييد نفسه، ولكن إذا كانا متباعدين فسيكونان على أجزاء مختلفة، ويتم تحديد أحجام الأجزاء واستخدامها لاستنتاج المسافة التقريبية بين علامتين، بحيث يتمثل الاختلاف بين هذه المعلومات وتحليل (RFLP) في أن تعيين التقييد يمكن أن يحدد المسافة بين علامتين كعدد الأزواج الأساسية، بينما يحدد تحليل (RFLP) عدد المرات التي يتم العثور فيها على علامتين مختلفتين معًا، ولكن المسافة الفعلية تعتمد على تردد تجميلي.
هناك ثلاث تقنيات أخرى لرسم الخرائط الفيزيائية هي رسم الخرائط الهجين الإشعاعي ورسم الخرائط الوراثية الخلوية و(FISH)، ويتم تحديد الموقع المادي لمسبار (DNA) معين في الكروموسومات الطورية من خلال موقعه بالنسبة لنمط النطاقات، وتوفر هذه الطريقة أدلة على ترتيب بيانات التسلسل في كونتيج واحد كبير، وقد تكون مجسات الحمض النووي في بعض الأحيان غير موثوقة؛ لأن الأجزاء الكبيرة المستنسخة قد تتكون في الواقع من جزأين من الحمض النووي، من أجزاء مختلفة من الجينوم يتم إدخالها في نفس الناقل.